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Bioinformática y ciencias de la vida

Las soluciones Mnemmix Graphics proveen la capacidad de cálculo ideal para procesos informáticos muy intensos como por ej. La secuencia y el acoplamiento de proteínas utilizando GPUs NvidiaTM compatibles con el lenguaje CUDA. Con el apoyo del NVIDIA Tesla Bio Workbench apoyamos a biofísicos y químicos computacionales a abrir nuevos caminos en la investigación bioquímica, optimizar los flujos de trabajo y acelerar el ritmo de la investigación científica.
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CUDASW++
Mejora velocidad:   10-50x
Aplicación:   Ricerca paralela de la base de datos del algoritmo
Smith-Waterman
   

Dinámica molecular

Las GPUs NvidiaTM integradas en nuestros sistemas ofrecen la arquitectura perfecta para la necesidad de procesamiento masivo en paralelo de las aplicaciones de dinámica molecular. Con el apoyo del NVIDIA Tesla Bio Workbench apoyamos a biofísicos y químicos computacionales a abrir nuevos caminos en la investigación bioquímica, optimizar los flujos de trabajo y acelerar el ritmo de la investigación científica.


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GROMASCS
Mejora velocidad:   165 ns/Day - DHFR
Aplicación:   Simulación de la dinámica molecular de sistemas con cientos de millones de partículas.

 
    Imágenes para medicina

Nuestras soluciones, basadas en tecnología híbrida soportan las aplicaciones médicas más conocidas. Hoy día, por ej. el campo médico recurre con frecuencia a la aceleración por GPU en los caso de detección temprana de la placa arterial y tomografías 3D generadas por ordenador. Las GPU proporcionan hasta 100 veces más capacidad de cálculo para la reconstrucción de imágenes y simulación, con lo que hacen factible la utilización de estas técnicas de simulación avanzadas en la práctica clínica.
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Digisens
Mejora velocidad:   100x
Aplicación:   Algoritmos de cálculo/reconstrucción, aplicación de filtro previo y posterior

 
Química cuántica

Proporcionamos soluciones GPU de alto desempeño basadas en NVIDIA® Tesla™ que soportan las principales aplicaciones en la rama de la química cuántica. Los modelajes de estructuras electrónicas son usados ampliamente por químicos, ingenieros, bioquímicos, físicos y otros que trabajan en la investigación química a nivel molecular. Esto permite a los investigadores estudiar y predecir las propiedades de las moléculas y reacciones en un amplio rango de situaciones, especialmente aquellas que son muy difíciles o imposibles de observar de forma experimental.
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TeraChem
Mejora velocidad:   44-650x
Aplicación:   Solución basada en GPU. Prestaciones comparadas con GAMESS versión CPU.

   

Análisis numérico

Las soluciones Mnemmix Graphics proporcionan una plataforma de alta prestaciones para las aplicaciones: MATLAB®, Mathematica y LabView. Dichas aplicaciones se benefician considerablemente del uso de GPUs basadas en CUDA. En el caso de MATLAB®, Parallel Computing Toolbox y MATLAB Distributed Computing Server los usuarios pueden aprovechar al máximo la potencia del GPU computing con unos sencillos cambios en el código de MATLAB existente. También les permite hacer llamadas a los kernels de CUDA directamente desde MATLAB.


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MathWorks MATLAB
Mejora velocidad:   3x-5x
Aplicación:   Kernels de CUDA con MATLAB, distribución de aplicaciones independientes con MATLAB

 

Física

Las aplicaciones aceleradas por GPU en el campo de la física son innumerables. Destacamos el soporte para la aplicación Chroma (Quantum Chromodynamics LQCD) utilizada en el CERN que simula como partículas elementales son atadas por la "fuerza mayor" creando partículas de mayor tamaño como protones y neutrones.


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Chroma
Mejora velocidad:   Desde 9x con posibilidad de escalar a miles de GPUs.
Aplicación:   Wilson-clover fermions, Krylov solvers, Descomposición de dominio
   

Modelos climatológicos,
atmosféricos y oceánicos,
y ciencias espaciales


Las soluciones Mnemmix Graphics proveen la plataforma ideal para aplicaciones de mecánica de fluidos aplicadas al cálculo de modelos climatológicos y oceánicos como por ej. el modelo WRF (Weather Research and Forecasting) y la simulación de maremotos y provee una extraordinaria aceleración basada en CUDA. Nuestras soluciones soportan aplicaciones WSM3 (modelos de microfísica del hielo), solución de ecuaciones lineales (CAM, MITgcm, HYCOM) entre otras, con un impresionante nivel de precisión.

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GEOS-5
Mejora velocidad:   10x Modelos, 3x Dinámicas
Aplicación:   Sistema de modelos integrado que utiliza el Earth System Modeling Framework (ESMF)

Las soluciones Mnemmix graphics


Las soluciones Mnemmix Graphics basadas en arquitectura Supermicro/ Nvidia se han diseñado desde la base para acelerar las cargas de trabajo científicas, técnicas y de producción audiovisual para dar respuesta a la necesidades de un plataforma de alta disponibilidad y prestaciones hasta ahora solo comparable a los inaccesibles superordenadores. Ofrecemos sistemas con validación de fábrica doble “cross-validation” donde todos los componentes están recíprocamente certificados por Supermicro y Nvidia.

 
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